RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637507.1

CAPN15-208, Transcript of calpain 15, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN15, Length 1,482 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15-208ENST00000637507 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.17■■■■■ 6.1
CAPN15-208ENST00000637507 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.12■■■■■ 5.13
CAPN15-208ENST00000637507 ABCC9O60706 1549 aa46.16■■■■■ 4.98
CAPN15-208ENST00000637507 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.55■■■■■ 4.72
CAPN15-208ENST00000637507 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.41■■■■■ 4.7
CAPN15-208ENST00000637507 NACADO15069 1562 aa44.41■■■■■ 4.7
CAPN15-208ENST00000637507 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.28■■■■■ 4.68
CAPN15-208ENST00000637507 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.19■■■■■ 4.67
CAPN15-208ENST00000637507 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.01■■■■■ 4.64
CAPN15-208ENST00000637507 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.22■■■■■ 4.51
CAPN15-208ENST00000637507 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.18■■■■■ 4.5
CAPN15-208ENST00000637507 SCRIBQ14160 1630 aa43.02■■■■■ 4.48
CAPN15-208ENST00000637507 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.99■■■■■ 4.47
CAPN15-208ENST00000637507 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.67■■■■■ 4.42
CAPN15-208ENST00000637507 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.35■■■■■ 4.37
CAPN15-208ENST00000637507 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
CAPN15-208ENST00000637507 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.69■■■■■ 4.26
CAPN15-208ENST00000637507 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.49■■■■■ 4.23
CAPN15-208ENST00000637507 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
CAPN15-208ENST00000637507 SMARCA4P51532 1647 aa41.18■■■■■ 4.18
CAPN15-208ENST00000637507 NCAPD3P42695 1498 aa41.03■■■■■ 4.16
CAPN15-208ENST00000637507 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.03■■■■■ 4.16
CAPN15-208ENST00000637507 SMARCA2P51531 1590 aa40.96■■■■■ 4.15
CAPN15-208ENST00000637507 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.95■■■■■ 4.15
CAPN15-208ENST00000637507 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.8■■■■■ 4.12
CAPN15-208ENST00000637507 HMGXB3Q12766 1538 aa40.75■■■■■ 4.11
CAPN15-208ENST00000637507 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
CAPN15-208ENST00000637507 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
CAPN15-208ENST00000637507 WIZO95785 1651 aa40.44■■■■■ 4.06
CAPN15-208ENST00000637507 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
CAPN15-208ENST00000637507 NESP48681 1621 aa39.93■■■■□ 3.98
CAPN15-208ENST00000637507 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.87■■■■□ 3.97
CAPN15-208ENST00000637507 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.86■■■■□ 3.97
CAPN15-208ENST00000637507 ERCC6Q03468 1493 aa39.83■■■■□ 3.97
CAPN15-208ENST00000637507 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.7■■■■□ 3.95
CAPN15-208ENST00000637507 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
CAPN15-208ENST00000637507 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.66■■■■□ 3.94
CAPN15-208ENST00000637507 CFTRP13569 1480 aa39.59■■■■□ 3.93
CAPN15-208ENST00000637507 CUX2O14529 1486 aa39.37■■■■□ 3.89
CAPN15-208ENST00000637507 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.35■■■■□ 3.89
CAPN15-208ENST00000637507 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.33■■■■□ 3.89
CAPN15-208ENST00000637507 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.29■■■■□ 3.88
CAPN15-208ENST00000637507 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
CAPN15-208ENST00000637507 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.21■■■■□ 3.87
CAPN15-208ENST00000637507 PRDM2Q13029 1718 aa39.05■■■■□ 3.84
CAPN15-208ENST00000637507 WDR62O43379 1518 aa39.03■■■■□ 3.84
CAPN15-208ENST00000637507 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
CAPN15-208ENST00000637507 ABCC8Q09428 1581 aa38.78■■■■□ 3.8
CAPN15-208ENST00000637507 TOPBP1Q92547 1522 aa38.7■■■■□ 3.79
CAPN15-208ENST00000637507 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.63■■■■□ 3.78
CAPN15-208ENST00000637507 IFT140Q96RY7 1462 aa38.49■■■■□ 3.75
CAPN15-208ENST00000637507 CUX1P39880 1505 aa38.4■■■■□ 3.74
CAPN15-208ENST00000637507 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.74
CAPN15-208ENST00000637507 SOGA1O94964 1423 aa38.3■■■■□ 3.72
CAPN15-208ENST00000637507 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.29■■■■□ 3.72
CAPN15-208ENST00000637507 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.27■■■■□ 3.72
CAPN15-208ENST00000637507 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.25■■■■□ 3.71
CAPN15-208ENST00000637507 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.22■■■■□ 3.71
CAPN15-208ENST00000637507 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
CAPN15-208ENST00000637507 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.16■■■■□ 3.7
CAPN15-208ENST00000637507 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.09■■■■□ 3.69
CAPN15-208ENST00000637507 TOP2BQ02880 1626 aa38.08■■■■□ 3.69
CAPN15-208ENST00000637507 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
CAPN15-208ENST00000637507 SYNJ1O43426 1573 aa38.04■■■■□ 3.68
CAPN15-208ENST00000637507 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
CAPN15-208ENST00000637507 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.02■■■■□ 3.68
CAPN15-208ENST00000637507 WDR97A6NE52 1622 aa37.95■■■■□ 3.67
CAPN15-208ENST00000637507 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.95■■■■□ 3.67
CAPN15-208ENST00000637507 OSCARQ8IYS5 282 aa37.87■■■■□ 3.65
CAPN15-208ENST00000637507 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.82■■■■□ 3.65
CAPN15-208ENST00000637507 GRIN2BQ13224 1484 aa37.82■■■■□ 3.64
CAPN15-208ENST00000637507 FBLN2P98095 1184 aa37.71■■■■□ 3.63
CAPN15-208ENST00000637507 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.71■■■■□ 3.63
CAPN15-208ENST00000637507 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
CAPN15-208ENST00000637507 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.69■■■■□ 3.62
CAPN15-208ENST00000637507 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
CAPN15-208ENST00000637507 SYNJ2O15056 1496 aa37.55■■■■□ 3.6
CAPN15-208ENST00000637507 PBRM1Q86U86 1689 aa37.54■■■■□ 3.6
CAPN15-208ENST00000637507 TRIM41Q8WV44 630 aa37.51■■■■□ 3.59
CAPN15-208ENST00000637507 KIF27Q86VH2 1401 aa37.5■■■■□ 3.59
CAPN15-208ENST00000637507 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.49■■■■□ 3.59
CAPN15-208ENST00000637507 CHD1O14646 1710 aa37.47■■■■□ 3.59
CAPN15-208ENST00000637507 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.42■■■■□ 3.58
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CAPN15-208ENST00000637507 ARHGEF11O15085 1522 aa37.1■■■■□ 3.53
CAPN15-208ENST00000637507 CUL7Q14999 1698 aa37.09■■■■□ 3.53
CAPN15-208ENST00000637507 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.07■■■■□ 3.53
CAPN15-208ENST00000637507 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.07■■■■□ 3.52
CAPN15-208ENST00000637507 CEP170Q5SW79 1584 aa37.03■■■■□ 3.52
CAPN15-208ENST00000637507 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.02■■■■□ 3.52
CAPN15-208ENST00000637507 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.02■■■■□ 3.52
CAPN15-208ENST00000637507 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.02■■■■□ 3.52
CAPN15-208ENST00000637507 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.88■■■■□ 3.49
CAPN15-208ENST00000637507 JPH4Q96JJ6 628 aa36.88■■■■□ 3.49
CAPN15-208ENST00000637507 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.87■■■■□ 3.49
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