Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SAMM50Q9Y512 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SAMM50Q9Y512 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SAMM50Q9Y512 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SAMM50Q9Y512 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SAMM50Q9Y512 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SAMM50Q9Y512 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SAMM50Q9Y512 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SAMM50Q9Y512 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SAMM50Q9Y512 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SAMM50Q9Y512 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SAMM50Q9Y512 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SAMM50Q9Y512 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SAMM50Q9Y512 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SAMM50Q9Y512 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SAMM50Q9Y512 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SAMM50Q9Y512 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMM50Q9Y512 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMM50Q9Y512 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SAMM50Q9Y512 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SAMM50Q9Y512 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SAMM50Q9Y512 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SAMM50Q9Y512 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SAMM50Q9Y512 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SAMM50Q9Y512 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SAMM50Q9Y512 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SAMM50Q9Y512 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SAMM50Q9Y512 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SAMM50Q9Y512 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SAMM50Q9Y512 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms