Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y467

SALL2, Sal-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL2Q9Y467 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SALL2Q9Y467 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SALL2Q9Y467 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SALL2Q9Y467 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SALL2Q9Y467 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SALL2Q9Y467 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SALL2Q9Y467 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SALL2Q9Y467 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SALL2Q9Y467 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SALL2Q9Y467 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SALL2Q9Y467 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SALL2Q9Y467 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SALL2Q9Y467 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SALL2Q9Y467 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SALL2Q9Y467 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SALL2Q9Y467 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SALL2Q9Y467 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SALL2Q9Y467 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SALL2Q9Y467 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SALL2Q9Y467 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SALL2Q9Y467 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SALL2Q9Y467 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SALL2Q9Y467 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SALL2Q9Y467 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SALL2Q9Y467 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms