Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SMC3Q9UQE7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMC3Q9UQE7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMC3Q9UQE7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMC3Q9UQE7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMC3Q9UQE7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMC3Q9UQE7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMC3Q9UQE7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMC3Q9UQE7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SMC3Q9UQE7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SMC3Q9UQE7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SMC3Q9UQE7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMC3Q9UQE7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SMC3Q9UQE7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SMC3Q9UQE7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SMC3Q9UQE7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMC3Q9UQE7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMC3Q9UQE7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC3Q9UQE7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms