Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ84

EXO1, Exonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO1Q9UQ84 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXO1Q9UQ84 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXO1Q9UQ84 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXO1Q9UQ84 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXO1Q9UQ84 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXO1Q9UQ84 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms