Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IGSF9BQ9UPX0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
IGSF9BQ9UPX0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF9BQ9UPX0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF9BQ9UPX0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF9BQ9UPX0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF9BQ9UPX0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF9BQ9UPX0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF9BQ9UPX0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF9BQ9UPX0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF9BQ9UPX0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGSF9BQ9UPX0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGSF9BQ9UPX0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF9BQ9UPX0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
IGSF9BQ9UPX0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IGSF9BQ9UPX0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IGSF9BQ9UPX0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF9BQ9UPX0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms