Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PACSIN3Q9UKS6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACSIN3Q9UKS6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3Q9UKS6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACSIN3Q9UKS6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3Q9UKS6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms