Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC23Q9UJX2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC23Q9UJX2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC23Q9UJX2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC23Q9UJX2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC23Q9UJX2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC23Q9UJX2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC23Q9UJX2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC23Q9UJX2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC23Q9UJX2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC23Q9UJX2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC23Q9UJX2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC23Q9UJX2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC23Q9UJX2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC23Q9UJX2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC23Q9UJX2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC23Q9UJX2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC23Q9UJX2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC23Q9UJX2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC23Q9UJX2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC23Q9UJX2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC23Q9UJX2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC23Q9UJX2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC23Q9UJX2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC23Q9UJX2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC23Q9UJX2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC23Q9UJX2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC23Q9UJX2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDC23Q9UJX2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms