Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EBF1Q9UH73 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EBF1Q9UH73 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
EBF1Q9UH73 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EBF1Q9UH73 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms