Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
EBF1Q9UH73 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
EBF1Q9UH73 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
EBF1Q9UH73 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
EBF1Q9UH73 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
EBF1Q9UH73 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
EBF1Q9UH73 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
EBF1Q9UH73 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
EBF1Q9UH73 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
EBF1Q9UH73 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
EBF1Q9UH73 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
EBF1Q9UH73 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
EBF1Q9UH73 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
EBF1Q9UH73 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
EBF1Q9UH73 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
EBF1Q9UH73 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EBF1Q9UH73 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EBF1Q9UH73 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
EBF1Q9UH73 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EBF1Q9UH73 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EBF1Q9UH73 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EBF1Q9UH73 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EBF1Q9UH73 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
EBF1Q9UH73 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
EBF1Q9UH73 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
EBF1Q9UH73 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
EBF1Q9UH73 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
EBF1Q9UH73 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
EBF1Q9UH73 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
EBF1Q9UH73 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EBF1Q9UH73 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EBF1Q9UH73 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EBF1Q9UH73 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EBF1Q9UH73 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
EBF1Q9UH73 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
EBF1Q9UH73 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
EBF1Q9UH73 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
EBF1Q9UH73 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EBF1Q9UH73 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
EBF1Q9UH73 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
EBF1Q9UH73 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
EBF1Q9UH73 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
EBF1Q9UH73 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EBF1Q9UH73 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
EBF1Q9UH73 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EBF1Q9UH73 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EBF1Q9UH73 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EBF1Q9UH73 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EBF1Q9UH73 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EBF1Q9UH73 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
EBF1Q9UH73 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
EBF1Q9UH73 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EBF1Q9UH73 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EBF1Q9UH73 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EBF1Q9UH73 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EBF1Q9UH73 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EBF1Q9UH73 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
EBF1Q9UH73 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
EBF1Q9UH73 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EBF1Q9UH73 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EBF1Q9UH73 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EBF1Q9UH73 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EBF1Q9UH73 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
EBF1Q9UH73 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EBF1Q9UH73 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EBF1Q9UH73 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EBF1Q9UH73 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EBF1Q9UH73 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EBF1Q9UH73 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EBF1Q9UH73 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EBF1Q9UH73 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EBF1Q9UH73 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EBF1Q9UH73 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EBF1Q9UH73 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EBF1Q9UH73 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EBF1Q9UH73 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EBF1Q9UH73 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EBF1Q9UH73 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EBF1Q9UH73 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EBF1Q9UH73 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EBF1Q9UH73 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EBF1Q9UH73 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
EBF1Q9UH73 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
EBF1Q9UH73 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EBF1Q9UH73 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EBF1Q9UH73 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EBF1Q9UH73 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
EBF1Q9UH73 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EBF1Q9UH73 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EBF1Q9UH73 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EBF1Q9UH73 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EBF1Q9UH73 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EBF1Q9UH73 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EBF1Q9UH73 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EBF1Q9UH73 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EBF1Q9UH73 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EBF1Q9UH73 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EBF1Q9UH73 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EBF1Q9UH73 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EBF1Q9UH73 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms