Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PARVAQ9NVD7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PARVAQ9NVD7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARVAQ9NVD7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARVAQ9NVD7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARVAQ9NVD7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms