Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHPT1Q9NRX4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHPT1Q9NRX4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHPT1Q9NRX4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHPT1Q9NRX4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms