Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQE9

HINT3, Histidine triad nucleotide-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINT3Q9NQE9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HINT3Q9NQE9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HINT3Q9NQE9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HINT3Q9NQE9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms