Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDH12Q9NPG4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDH12Q9NPG4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDH12Q9NPG4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH12Q9NPG4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH12Q9NPG4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH12Q9NPG4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH12Q9NPG4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDH12Q9NPG4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDH12Q9NPG4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDH12Q9NPG4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDH12Q9NPG4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDH12Q9NPG4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDH12Q9NPG4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDH12Q9NPG4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDH12Q9NPG4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDH12Q9NPG4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH12Q9NPG4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDH12Q9NPG4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDH12Q9NPG4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms