Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MID1IP1Q9NPA3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MID1IP1Q9NPA3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MID1IP1Q9NPA3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MID1IP1Q9NPA3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MID1IP1Q9NPA3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MID1IP1Q9NPA3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MID1IP1Q9NPA3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MID1IP1Q9NPA3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MID1IP1Q9NPA3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MID1IP1Q9NPA3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MID1IP1Q9NPA3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MID1IP1Q9NPA3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MID1IP1Q9NPA3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MID1IP1Q9NPA3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MID1IP1Q9NPA3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MID1IP1Q9NPA3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms