Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB18Q9NP72 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB18Q9NP72 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB18Q9NP72 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms