Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB18Q9NP72 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB18Q9NP72 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB18Q9NP72 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB18Q9NP72 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB18Q9NP72 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB18Q9NP72 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB18Q9NP72 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB18Q9NP72 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB18Q9NP72 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB18Q9NP72 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB18Q9NP72 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB18Q9NP72 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB18Q9NP72 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB18Q9NP72 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB18Q9NP72 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB18Q9NP72 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB18Q9NP72 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB18Q9NP72 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB18Q9NP72 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB18Q9NP72 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB18Q9NP72 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB18Q9NP72 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB18Q9NP72 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB18Q9NP72 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB18Q9NP72 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB18Q9NP72 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB18Q9NP72 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB18Q9NP72 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB18Q9NP72 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB18Q9NP72 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB18Q9NP72 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB18Q9NP72 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB18Q9NP72 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB18Q9NP72 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB18Q9NP72 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB18Q9NP72 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB18Q9NP72 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB18Q9NP72 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB18Q9NP72 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB18Q9NP72 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB18Q9NP72 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB18Q9NP72 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB18Q9NP72 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB18Q9NP72 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB18Q9NP72 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB18Q9NP72 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB18Q9NP72 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB18Q9NP72 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB18Q9NP72 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB18Q9NP72 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB18Q9NP72 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB18Q9NP72 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB18Q9NP72 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB18Q9NP72 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB18Q9NP72 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB18Q9NP72 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB18Q9NP72 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB18Q9NP72 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB18Q9NP72 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB18Q9NP72 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB18Q9NP72 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB18Q9NP72 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB18Q9NP72 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB18Q9NP72 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB18Q9NP72 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB18Q9NP72 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB18Q9NP72 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB18Q9NP72 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB18Q9NP72 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB18Q9NP72 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB18Q9NP72 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB18Q9NP72 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB18Q9NP72 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB18Q9NP72 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB18Q9NP72 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB18Q9NP72 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB18Q9NP72 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB18Q9NP72 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB18Q9NP72 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB18Q9NP72 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB18Q9NP72 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB18Q9NP72 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB18Q9NP72 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB18Q9NP72 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB18Q9NP72 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB18Q9NP72 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB18Q9NP72 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB18Q9NP72 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB18Q9NP72 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB18Q9NP72 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB18Q9NP72 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB18Q9NP72 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB18Q9NP72 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB18Q9NP72 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB18Q9NP72 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB18Q9NP72 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB18Q9NP72 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB18Q9NP72 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB18Q9NP72 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms