Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VAT1LQ9HCJ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VAT1LQ9HCJ6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
VAT1LQ9HCJ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VAT1LQ9HCJ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms