Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y2

RPF1, Ribosome production factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF1Q9H9Y2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPF1Q9H9Y2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPF1Q9H9Y2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RPF1Q9H9Y2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPF1Q9H9Y2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPF1Q9H9Y2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPF1Q9H9Y2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPF1Q9H9Y2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPF1Q9H9Y2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPF1Q9H9Y2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPF1Q9H9Y2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPF1Q9H9Y2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPF1Q9H9Y2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPF1Q9H9Y2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPF1Q9H9Y2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RPF1Q9H9Y2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPF1Q9H9Y2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms