Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7J1

PPP1R3E, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3E, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3EQ9H7J1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R3EQ9H7J1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPP1R3EQ9H7J1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3EQ9H7J1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms