Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNMDQ9H2S6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNMDQ9H2S6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNMDQ9H2S6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNMDQ9H2S6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNMDQ9H2S6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms