Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF39Q9H2S5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF39Q9H2S5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF39Q9H2S5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF39Q9H2S5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF39Q9H2S5 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms