Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2A7

CXCL16, C-X-C motif chemokine 16, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16Q9H2A7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CXCL16Q9H2A7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CXCL16Q9H2A7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CXCL16Q9H2A7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CXCL16Q9H2A7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CXCL16Q9H2A7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CXCL16Q9H2A7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL16Q9H2A7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL16Q9H2A7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL16Q9H2A7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL16Q9H2A7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CXCL16Q9H2A7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CXCL16Q9H2A7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CXCL16Q9H2A7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CXCL16Q9H2A7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CXCL16Q9H2A7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CXCL16Q9H2A7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CXCL16Q9H2A7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CXCL16Q9H2A7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CXCL16Q9H2A7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CXCL16Q9H2A7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CXCL16Q9H2A7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CXCL16Q9H2A7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CXCL16Q9H2A7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CXCL16Q9H2A7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXCL16Q9H2A7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXCL16Q9H2A7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXCL16Q9H2A7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CXCL16Q9H2A7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CXCL16Q9H2A7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CXCL16Q9H2A7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CXCL16Q9H2A7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL16Q9H2A7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms