Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXP3Q9BZS1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXP3Q9BZS1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXP3Q9BZS1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXP3Q9BZS1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXP3Q9BZS1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXP3Q9BZS1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXP3Q9BZS1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXP3Q9BZS1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXP3Q9BZS1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXP3Q9BZS1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXP3Q9BZS1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXP3Q9BZS1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXP3Q9BZS1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXP3Q9BZS1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXP3Q9BZS1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXP3Q9BZS1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXP3Q9BZS1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXP3Q9BZS1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms