Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
CARD11Q9BXL7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
CARD11Q9BXL7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CARD11Q9BXL7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CARD11Q9BXL7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CARD11Q9BXL7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CARD11Q9BXL7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CARD11Q9BXL7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CARD11Q9BXL7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CARD11Q9BXL7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CARD11Q9BXL7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CARD11Q9BXL7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CARD11Q9BXL7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CARD11Q9BXL7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CARD11Q9BXL7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CARD11Q9BXL7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CARD11Q9BXL7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CARD11Q9BXL7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CARD11Q9BXL7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARD11Q9BXL7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CARD11Q9BXL7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARD11Q9BXL7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CARD11Q9BXL7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CARD11Q9BXL7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CARD11Q9BXL7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CARD11Q9BXL7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CARD11Q9BXL7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARD11Q9BXL7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARD11Q9BXL7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARD11Q9BXL7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARD11Q9BXL7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARD11Q9BXL7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARD11Q9BXL7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARD11Q9BXL7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CARD11Q9BXL7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CARD11Q9BXL7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CARD11Q9BXL7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CARD11Q9BXL7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CARD11Q9BXL7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CARD11Q9BXL7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CARD11Q9BXL7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CARD11Q9BXL7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
CARD11Q9BXL7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CARD11Q9BXL7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CARD11Q9BXL7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CARD11Q9BXL7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CARD11Q9BXL7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CARD11Q9BXL7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CARD11Q9BXL7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARD11Q9BXL7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARD11Q9BXL7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARD11Q9BXL7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARD11Q9BXL7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CARD11Q9BXL7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARD11Q9BXL7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARD11Q9BXL7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARD11Q9BXL7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CARD11Q9BXL7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CARD11Q9BXL7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CARD11Q9BXL7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms