Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH2

FUNDC2, FUN14 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC2Q9BWH2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FUNDC2Q9BWH2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FUNDC2Q9BWH2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FUNDC2Q9BWH2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC2Q9BWH2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms