Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH2

FUNDC2, FUN14 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC2Q9BWH2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FUNDC2Q9BWH2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FUNDC2Q9BWH2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FUNDC2Q9BWH2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FUNDC2Q9BWH2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FUNDC2Q9BWH2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FUNDC2Q9BWH2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FUNDC2Q9BWH2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FUNDC2Q9BWH2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FUNDC2Q9BWH2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FUNDC2Q9BWH2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FUNDC2Q9BWH2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FUNDC2Q9BWH2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FUNDC2Q9BWH2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FUNDC2Q9BWH2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FUNDC2Q9BWH2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FUNDC2Q9BWH2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FUNDC2Q9BWH2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FUNDC2Q9BWH2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FUNDC2Q9BWH2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FUNDC2Q9BWH2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FUNDC2Q9BWH2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FUNDC2Q9BWH2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FUNDC2Q9BWH2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FUNDC2Q9BWH2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FUNDC2Q9BWH2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FUNDC2Q9BWH2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FUNDC2Q9BWH2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FUNDC2Q9BWH2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FUNDC2Q9BWH2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FUNDC2Q9BWH2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FUNDC2Q9BWH2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FUNDC2Q9BWH2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FUNDC2Q9BWH2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FUNDC2Q9BWH2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FUNDC2Q9BWH2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FUNDC2Q9BWH2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FUNDC2Q9BWH2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FUNDC2Q9BWH2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FUNDC2Q9BWH2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FUNDC2Q9BWH2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FUNDC2Q9BWH2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FUNDC2Q9BWH2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FUNDC2Q9BWH2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FUNDC2Q9BWH2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FUNDC2Q9BWH2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FUNDC2Q9BWH2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
FUNDC2Q9BWH2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FUNDC2Q9BWH2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FUNDC2Q9BWH2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FUNDC2Q9BWH2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FUNDC2Q9BWH2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FUNDC2Q9BWH2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FUNDC2Q9BWH2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FUNDC2Q9BWH2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FUNDC2Q9BWH2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FUNDC2Q9BWH2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FUNDC2Q9BWH2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FUNDC2Q9BWH2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FUNDC2Q9BWH2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FUNDC2Q9BWH2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FUNDC2Q9BWH2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FUNDC2Q9BWH2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FUNDC2Q9BWH2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FUNDC2Q9BWH2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FUNDC2Q9BWH2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FUNDC2Q9BWH2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FUNDC2Q9BWH2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FUNDC2Q9BWH2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FUNDC2Q9BWH2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FUNDC2Q9BWH2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FUNDC2Q9BWH2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FUNDC2Q9BWH2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FUNDC2Q9BWH2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FUNDC2Q9BWH2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FUNDC2Q9BWH2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FUNDC2Q9BWH2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FUNDC2Q9BWH2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FUNDC2Q9BWH2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FUNDC2Q9BWH2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FUNDC2Q9BWH2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FUNDC2Q9BWH2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FUNDC2Q9BWH2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FUNDC2Q9BWH2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FUNDC2Q9BWH2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FUNDC2Q9BWH2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FUNDC2Q9BWH2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FUNDC2Q9BWH2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FUNDC2Q9BWH2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FUNDC2Q9BWH2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
FUNDC2Q9BWH2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FUNDC2Q9BWH2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FUNDC2Q9BWH2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FUNDC2Q9BWH2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FUNDC2Q9BWH2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FUNDC2Q9BWH2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FUNDC2Q9BWH2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FUNDC2Q9BWH2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FUNDC2Q9BWH2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FUNDC2Q9BWH2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms