Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD3Q9BV44 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THUMPD3Q9BV44 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THUMPD3Q9BV44 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms