Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf50Q9BV19 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf50Q9BV19 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf50Q9BV19 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf50Q9BV19 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms