Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RILPQ96NA2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RILPQ96NA2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RILPQ96NA2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RILPQ96NA2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms