Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCD1Q96GM5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCD1Q96GM5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCD1Q96GM5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCD1Q96GM5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCD1Q96GM5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCD1Q96GM5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCD1Q96GM5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCD1Q96GM5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCD1Q96GM5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCD1Q96GM5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCD1Q96GM5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCD1Q96GM5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCD1Q96GM5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCD1Q96GM5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCD1Q96GM5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCD1Q96GM5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCD1Q96GM5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCD1Q96GM5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCD1Q96GM5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCD1Q96GM5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCD1Q96GM5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCD1Q96GM5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCD1Q96GM5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCD1Q96GM5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCD1Q96GM5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCD1Q96GM5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCD1Q96GM5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCD1Q96GM5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCD1Q96GM5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCD1Q96GM5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCD1Q96GM5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCD1Q96GM5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCD1Q96GM5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCD1Q96GM5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCD1Q96GM5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCD1Q96GM5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCD1Q96GM5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCD1Q96GM5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms