Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDXPQ96GD0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXPQ96GD0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXPQ96GD0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXPQ96GD0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXPQ96GD0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXPQ96GD0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDXPQ96GD0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDXPQ96GD0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDXPQ96GD0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDXPQ96GD0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDXPQ96GD0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDXPQ96GD0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDXPQ96GD0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDXPQ96GD0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDXPQ96GD0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDXPQ96GD0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDXPQ96GD0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDXPQ96GD0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDXPQ96GD0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDXPQ96GD0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDXPQ96GD0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDXPQ96GD0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDXPQ96GD0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDXPQ96GD0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDXPQ96GD0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDXPQ96GD0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms