Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH6

RAB40A, Ras-related protein Rab-40A, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40AQ8WXH6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB40AQ8WXH6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB40AQ8WXH6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms