Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH6

RAB40A, Ras-related protein Rab-40A, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40AQ8WXH6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
RAB40AQ8WXH6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB40AQ8WXH6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAB40AQ8WXH6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB40AQ8WXH6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB40AQ8WXH6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB40AQ8WXH6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB40AQ8WXH6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB40AQ8WXH6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB40AQ8WXH6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB40AQ8WXH6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB40AQ8WXH6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RAB40AQ8WXH6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB40AQ8WXH6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB40AQ8WXH6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB40AQ8WXH6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB40AQ8WXH6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB40AQ8WXH6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB40AQ8WXH6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAB40AQ8WXH6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB40AQ8WXH6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB40AQ8WXH6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB40AQ8WXH6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB40AQ8WXH6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB40AQ8WXH6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB40AQ8WXH6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB40AQ8WXH6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB40AQ8WXH6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB40AQ8WXH6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB40AQ8WXH6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB40AQ8WXH6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB40AQ8WXH6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB40AQ8WXH6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB40AQ8WXH6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB40AQ8WXH6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB40AQ8WXH6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB40AQ8WXH6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB40AQ8WXH6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB40AQ8WXH6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB40AQ8WXH6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB40AQ8WXH6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB40AQ8WXH6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB40AQ8WXH6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB40AQ8WXH6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB40AQ8WXH6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB40AQ8WXH6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB40AQ8WXH6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB40AQ8WXH6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB40AQ8WXH6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB40AQ8WXH6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB40AQ8WXH6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB40AQ8WXH6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB40AQ8WXH6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB40AQ8WXH6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB40AQ8WXH6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB40AQ8WXH6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB40AQ8WXH6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB40AQ8WXH6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB40AQ8WXH6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB40AQ8WXH6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB40AQ8WXH6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB40AQ8WXH6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB40AQ8WXH6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB40AQ8WXH6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB40AQ8WXH6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB40AQ8WXH6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB40AQ8WXH6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB40AQ8WXH6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB40AQ8WXH6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB40AQ8WXH6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAB40AQ8WXH6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB40AQ8WXH6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB40AQ8WXH6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB40AQ8WXH6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB40AQ8WXH6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB40AQ8WXH6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB40AQ8WXH6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB40AQ8WXH6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RAB40AQ8WXH6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB40AQ8WXH6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB40AQ8WXH6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB40AQ8WXH6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB40AQ8WXH6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB40AQ8WXH6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB40AQ8WXH6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB40AQ8WXH6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB40AQ8WXH6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB40AQ8WXH6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB40AQ8WXH6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB40AQ8WXH6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB40AQ8WXH6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB40AQ8WXH6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB40AQ8WXH6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB40AQ8WXH6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB40AQ8WXH6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB40AQ8WXH6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB40AQ8WXH6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB40AQ8WXH6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB40AQ8WXH6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB40AQ8WXH6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms