Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAG3L4Q8TBR4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STAG3L4Q8TBR4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG3L4Q8TBR4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms