Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC9Q8TBE3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC9Q8TBE3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC9Q8TBE3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC9Q8TBE3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms