Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNIH3Q8TBE1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNIH3Q8TBE1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNIH3Q8TBE1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNIH3Q8TBE1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms