Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3C3Q8NEB9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3C3Q8NEB9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3C3Q8NEB9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms