Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDPRQ8NCN5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDPRQ8NCN5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDPRQ8NCN5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDPRQ8NCN5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms