Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HJURPQ8NCD3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HJURPQ8NCD3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HJURPQ8NCD3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HJURPQ8NCD3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HJURPQ8NCD3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HJURPQ8NCD3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms