Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q9

NIPA2, Magnesium transporter NIPA2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA2Q8N8Q9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NIPA2Q8N8Q9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NIPA2Q8N8Q9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NIPA2Q8N8Q9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NIPA2Q8N8Q9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NIPA2Q8N8Q9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NIPA2Q8N8Q9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NIPA2Q8N8Q9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIPA2Q8N8Q9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIPA2Q8N8Q9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIPA2Q8N8Q9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIPA2Q8N8Q9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIPA2Q8N8Q9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIPA2Q8N8Q9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIPA2Q8N8Q9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NIPA2Q8N8Q9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NIPA2Q8N8Q9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NIPA2Q8N8Q9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NIPA2Q8N8Q9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NIPA2Q8N8Q9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NIPA2Q8N8Q9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIPA2Q8N8Q9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIPA2Q8N8Q9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIPA2Q8N8Q9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIPA2Q8N8Q9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIPA2Q8N8Q9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIPA2Q8N8Q9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIPA2Q8N8Q9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIPA2Q8N8Q9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIPA2Q8N8Q9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIPA2Q8N8Q9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIPA2Q8N8Q9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms