Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM135Q86UB9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM135Q86UB9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM135Q86UB9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM135Q86UB9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms