Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RD3Q7Z3Z2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RD3Q7Z3Z2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RD3Q7Z3Z2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms