Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RUFY3Q7L099 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RUFY3Q7L099 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RUFY3Q7L099 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RUFY3Q7L099 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RUFY3Q7L099 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RUFY3Q7L099 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RUFY3Q7L099 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RUFY3Q7L099 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RUFY3Q7L099 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RUFY3Q7L099 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RUFY3Q7L099 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
RUFY3Q7L099 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RUFY3Q7L099 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RUFY3Q7L099 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RUFY3Q7L099 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RUFY3Q7L099 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUFY3Q7L099 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUFY3Q7L099 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUFY3Q7L099 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RUFY3Q7L099 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RUFY3Q7L099 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RUFY3Q7L099 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RUFY3Q7L099 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUFY3Q7L099 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUFY3Q7L099 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUFY3Q7L099 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RUFY3Q7L099 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
RUFY3Q7L099 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms