Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SND1Q7KZF4 TFRC-211ENST00000475593 875 ntTSL 36.15□□□□□ -1.424e-12■■■■■ 33.8
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SND1Q7KZF4 STEAP3-203ENST00000393110 4262 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.622e-8■■■■■ 33.7
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SND1Q7KZF4 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.671e-6■■■■■ 32.9
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SND1Q7KZF4 COCH-210ENST00000556908 775 ntTSL 319.94■□□□□ 0.787e-9■■■■■ 32.9
SND1Q7KZF4 COCH-207ENST00000553833 635 ntTSL 58.42□□□□□ -1.067e-9■■■■■ 32.9
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SND1Q7KZF4 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.69□□□□□ -1.026e-9■■■■■ 32.8
SND1Q7KZF4 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 58.05□□□□□ -1.126e-9■■■■■ 32.8
SND1Q7KZF4 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 57.45□□□□□ -1.226e-9■■■■■ 32.8
SND1Q7KZF4 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 47.04□□□□□ -1.286e-9■■■■■ 32.8
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SND1Q7KZF4 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.244e-10■■■■■ 32.8
SND1Q7KZF4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.353e-8■■■■■ 32.8
SND1Q7KZF4 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 32.8
SND1Q7KZF4 MCFD2-207ENST00000409913 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 32.8
SND1Q7KZF4 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.233e-8■■■■■ 32.8
SND1Q7KZF4 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.243e-8■■■■■ 32.8
SND1Q7KZF4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 32.7
SND1Q7KZF4 MFAP3-209ENST00000521527 716 ntTSL 315.55■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 32.7
SND1Q7KZF4 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 32.7
SND1Q7KZF4 MFAP3-207ENST00000520327 374 ntTSL 511.11□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 32.7
SND1Q7KZF4 CYC1-204ENST00000533444 1832 ntTSL 1 (best)28.61■■■□□ 2.172e-12■■■■■ 32.7
SND1Q7KZF4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.182e-12■■■■■ 32.7
SND1Q7KZF4 C3-216ENST00000601475 368 ntTSL 29.23□□□□□ -0.931e-323■■■■■ 32.7
SND1Q7KZF4 GLG1-209ENST00000565260 461 ntTSL 527.87■■■□□ 2.054e-11■■■■■ 32.7
SND1Q7KZF4 METTL7A-204ENST00000550097 1846 ntTSL 515.4■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 32.6
SND1Q7KZF4 METTL7A-202ENST00000547104 1825 ntTSL 1 (best)13.6□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 32.6
SND1Q7KZF4 METTL7A-203ENST00000548553 4076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81e-8■■■■■ 32.6
SND1Q7KZF4 METTL7A-201ENST00000332160 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.831e-8■■■■■ 32.6
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SND1Q7KZF4 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.371e-20■■■■■ 32.6
SND1Q7KZF4 GANAB-201ENST00000346178 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.641e-20■■■■■ 32.6
SND1Q7KZF4 GANAB-211ENST00000532402 3718 ntTSL 1 (best)10.51□□□□□ -0.731e-20■■■■■ 32.6
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