RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511045.5

MTTP-208, Transcript of microsomal triglyceride transfer protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MTTP, Length 3,154 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTP-208ENST00000511045 NISCHQ9Y2I1 1504 aa18.19■□□□□ 0.5
MTTP-208ENST00000511045 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa15.74■□□□□ 0.11
MTTP-208ENST00000511045 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
MTTP-208ENST00000511045 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa15.1■□□□□ 0.01
MTTP-208ENST00000511045 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa15.03■□□□□ -0
MTTP-208ENST00000511045 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.81□□□□□ -0.04
MTTP-208ENST00000511045 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.78□□□□□ -0.04
MTTP-208ENST00000511045 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
MTTP-208ENST00000511045 NACADO15069 1562 aa14.55□□□□□ -0.08
MTTP-208ENST00000511045 ABCC9O60706 1549 aa14.47□□□□□ -0.09
MTTP-208ENST00000511045 SCRIBQ14160 1630 aa14.45□□□□□ -0.1
MTTP-208ENST00000511045 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.33□□□□□ -0.12
MTTP-208ENST00000511045 CHIC1Q5VXU3 224 aa14.29□□□□□ -0.12
MTTP-208ENST00000511045 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
MTTP-208ENST00000511045 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.04□□□□□ -0.16
MTTP-208ENST00000511045 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
MTTP-208ENST00000511045 MROH2BQ7Z745 1585 aa14.03□□□□□ -0.16
MTTP-208ENST00000511045 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.01□□□□□ -0.17
MTTP-208ENST00000511045 WIZO95785 1651 aa13.95□□□□□ -0.18
MTTP-208ENST00000511045 SMARCA4P51532 1647 aa13.91□□□□□ -0.18
MTTP-208ENST00000511045 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
MTTP-208ENST00000511045 BICRAQ9NZM4 1560 aa13.83□□□□□ -0.2
MTTP-208ENST00000511045 TRIM41Q8WV44 630 aa13.82□□□□□ -0.2
MTTP-208ENST00000511045 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
MTTP-208ENST00000511045 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.74□□□□□ -0.21
MTTP-208ENST00000511045 SMARCA2P51531 1590 aa13.72□□□□□ -0.21
MTTP-208ENST00000511045 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa13.71□□□□□ -0.22
MTTP-208ENST00000511045 CCDC88BA6NC98 1476 aa13.69□□□□□ -0.22
MTTP-208ENST00000511045 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP13.65□□□□□ -0.23
MTTP-208ENST00000511045 HRCP23327 699 aa13.57□□□□□ -0.24
MTTP-208ENST00000511045 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa13.56□□□□□ -0.24
MTTP-208ENST00000511045 PCGF6Q9BYE7 350 aa13.53□□□□□ -0.24
MTTP-208ENST00000511045 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
MTTP-208ENST00000511045 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
MTTP-208ENST00000511045 EEA1Q15075 1411 aa13.51□□□□□ -0.25
MTTP-208ENST00000511045 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
MTTP-208ENST00000511045 ABCC8Q09428 1581 aa13.5□□□□□ -0.25
MTTP-208ENST00000511045 HMGXB3Q12766 1538 aa13.44□□□□□ -0.26
MTTP-208ENST00000511045 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.41□□□□□ -0.26
MTTP-208ENST00000511045 NCAPD3P42695 1498 aa13.4□□□□□ -0.27
MTTP-208ENST00000511045 TNIKQ9UKE5 1360 aa13.33□□□□□ -0.28
MTTP-208ENST00000511045 SOGA1O94964 1423 aa13.33□□□□□ -0.28
MTTP-208ENST00000511045 SYNJ1O43426 1573 aa13.33□□□□□ -0.28
MTTP-208ENST00000511045 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.32□□□□□ -0.28
MTTP-208ENST00000511045 GOLGA3Q08378 1498 aa13.3□□□□□ -0.28
MTTP-208ENST00000511045 KIF21BO75037 1637 aa13.28□□□□□ -0.28
MTTP-208ENST00000511045 TOP2BQ02880 1626 aa13.28□□□□□ -0.28
MTTP-208ENST00000511045 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa13.27□□□□□ -0.28
MTTP-208ENST00000511045 EHMT2Q96KQ7 1210 aa13.26□□□□□ -0.29
MTTP-208ENST00000511045 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.26□□□□□ -0.29
MTTP-208ENST00000511045 CEP162Q5TB80 1403 aa13.26□□□□□ -0.29
MTTP-208ENST00000511045 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
MTTP-208ENST00000511045 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.23□□□□□ -0.29
MTTP-208ENST00000511045 PRDM2Q13029 1718 aa13.22□□□□□ -0.29
MTTP-208ENST00000511045 CFTRP13569 1480 aa13.2□□□□□ -0.3
MTTP-208ENST00000511045 UBTFP17480 764 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
MTTP-208ENST00000511045 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.12□□□□□ -0.31
MTTP-208ENST00000511045 CUX1P39880 1505 aa13.11□□□□□ -0.31
MTTP-208ENST00000511045 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa13.09□□□□□ -0.31
MTTP-208ENST00000511045 CLIP1P30622 1438 aa13.07□□□□□ -0.32
MTTP-208ENST00000511045 CADPSQ9ULU8 1353 aa13.07□□□□□ -0.32
MTTP-208ENST00000511045 KIF27Q86VH2 1401 aa13.06□□□□□ -0.32
MTTP-208ENST00000511045 PRXQ9BXM0 1461 aa13.06□□□□□ -0.32
MTTP-208ENST00000511045 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa13.06□□□□□ -0.32
MTTP-208ENST00000511045 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
MTTP-208ENST00000511045 VPS8Q8N3P4 1428 aa13.03□□□□□ -0.32
MTTP-208ENST00000511045 APLP2Q06481 763 aa12.93□□□□□ -0.34
MTTP-208ENST00000511045 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.93□□□□□ -0.34
MTTP-208ENST00000511045 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.92□□□□□ -0.34
MTTP-208ENST00000511045 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.91□□□□□ -0.34
MTTP-208ENST00000511045 CUX2O14529 1486 aa12.91□□□□□ -0.34
MTTP-208ENST00000511045 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa12.9□□□□□ -0.34
MTTP-208ENST00000511045 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
MTTP-208ENST00000511045 ARAP1Q96P48 1450 aa12.88□□□□□ -0.35
MTTP-208ENST00000511045 IGF1RP08069 1367 aa12.86□□□□□ -0.35
MTTP-208ENST00000511045 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.84□□□□□ -0.35
MTTP-208ENST00000511045 TOPBP1Q92547 1522 aa12.83□□□□□ -0.36
MTTP-208ENST00000511045 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
MTTP-208ENST00000511045 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.82□□□□□ -0.36
MTTP-208ENST00000511045 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
MTTP-208ENST00000511045 CUL7Q14999 1698 aa12.81□□□□□ -0.36
MTTP-208ENST00000511045 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.8□□□□□ -0.36
MTTP-208ENST00000511045 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
MTTP-208ENST00000511045 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.78□□□□□ -0.36
MTTP-208ENST00000511045 MAP3K1Q13233 1512 aa12.78□□□□□ -0.36
MTTP-208ENST00000511045 NESP48681 1621 aa12.77□□□□□ -0.37
MTTP-208ENST00000511045 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
MTTP-208ENST00000511045 WDR97A6NE52 1622 aa12.76□□□□□ -0.37
MTTP-208ENST00000511045 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.73□□□□□ -0.37
MTTP-208ENST00000511045 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
MTTP-208ENST00000511045 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.72□□□□□ -0.37
MTTP-208ENST00000511045 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.72□□□□□ -0.37
MTTP-208ENST00000511045 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
MTTP-208ENST00000511045 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.7□□□□□ -0.38
MTTP-208ENST00000511045 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.69□□□□□ -0.38
MTTP-208ENST00000511045 TIAM1Q13009 1591 aa12.68□□□□□ -0.38
MTTP-208ENST00000511045 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
MTTP-208ENST00000511045 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.67□□□□□ -0.38
MTTP-208ENST00000511045 CLSPNQ9HAW4 1339 aa12.66□□□□□ -0.38
MTTP-208ENST00000511045 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
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