Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHISA6Q6ZSJ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHISA6Q6ZSJ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHISA6Q6ZSJ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHISA6Q6ZSJ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHISA6Q6ZSJ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHISA6Q6ZSJ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHISA6Q6ZSJ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHISA6Q6ZSJ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHISA6Q6ZSJ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHISA6Q6ZSJ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHISA6Q6ZSJ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHISA6Q6ZSJ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHISA6Q6ZSJ9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHISA6Q6ZSJ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHISA6Q6ZSJ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHISA6Q6ZSJ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHISA6Q6ZSJ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHISA6Q6ZSJ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHISA6Q6ZSJ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHISA6Q6ZSJ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHISA6Q6ZSJ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHISA6Q6ZSJ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHISA6Q6ZSJ9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHISA6Q6ZSJ9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHISA6Q6ZSJ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHISA6Q6ZSJ9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHISA6Q6ZSJ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHISA6Q6ZSJ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHISA6Q6ZSJ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHISA6Q6ZSJ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHISA6Q6ZSJ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms