Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBSNQ6UWP8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBSNQ6UWP8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SBSNQ6UWP8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SBSNQ6UWP8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBSNQ6UWP8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms