Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
REEP3Q6NUK4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
REEP3Q6NUK4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
REEP3Q6NUK4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REEP3Q6NUK4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms