Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAPCD1Q5SSQ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAPCD1Q5SSQ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAPCD1Q5SSQ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms